柑橘潰瘍病是柑橘種植當中危害最大的病害之一，要想防治柑橘潰瘍病，首先要做到以下幾點，從而才能降低病害的發病率，實行嚴格檢疫、應用無病苗木、加強肥水管理等。
1.實行嚴格檢疫
禁止從病區輸入柑橘苗木、接穗、砧木、種子、果實等。若必須從病區引進柑橘的繁殖材料，則應在隔離區試種，經1-2年，證實無潰瘍病后方可在無病區種植。一旦發現病情，應立即加以撲滅。
2.應用無病苗木
苗圃應設在無病區內，周圍1公里以上無柑橘類的植物。砧木種子應采自無病果實，接穗采自無病區或無病果園。砧木及接穗都要經過消毒才能進入無病苗圃。
砧木種子消毒方法：先將種子裝入紗布袋或鐵絲籠內，放入50-52℃熱水中預熱5分鐘，后轉入55-56℃恒溫熱水中浸50分鐘，晾干后播種。接穗消毒是把接穗在每毫升含700單位硫酸鏈霉素和1%乙醇的混合液中浸30分鐘，取出靜置20-30分鐘，清水沖洗、晾干，用清潔草紙包裝保溫貯藏或嫁接。
育苗期間發現病株應及時燒毀，并噴藥保護附近的健苗，出圃的苗木要經嚴格檢疫，確證無病后，才允許出圃。
3.加強肥水管理，使其抽梢統一整齊
梢期，尤其是秋梢期，應及時做好潛葉蛾的防治。若發現有病株應及時挖除、燒毀，并噴藥保護周圍的健苗，再用無病苗補種。
在疫區，通過加強肥水管理控制枝梢的同時，可采取以潰腐靈清園為中心，結合適時的噴藥防治。
（1）清理果園
冬季做好清園工作，每年收果后，收集落葉、落果和枯枝，加以燒毀。早春結合修剪，除去病蟲枝、病葉、徒長枝、弱枝等，以減少病害侵染來源。噴1-2次潰腐靈+有機硅。尤其在春、秋梢期的新梢抽出前，先把病枝、病葉盡量清除，病斑很多的大枝條也要剪除，集中燒毀。堅持做到先清園，才放新梢。
（2）噴藥保護
沃柑潰瘍病的病菌最容易侵染幼嫩的組織，如嫩芽、花蕾、幼果等，要抓住組織幼嫩階段進行防治。
花期、展葉期噴霧（3月中旬至5月下旬）、謝花期（5月中旬）定期噴霧《靚果安》300倍+《沃豐素》600倍，殺菌預防病害的同時提高蠟質層厚度，增加免疫力。再次，是要注意在臺風雨前后、暴雨來臨噴藥防治。